Roche uPath IVD Руководство пользователя

Анализ изображений uPath

HER2 Dual ISH для справочника

по алгоритму анализа тканей

молочной железы

Оглавление

Введение 1

Краткий обзор и разъяснение алгоритма 2

Клиническая значимость 3

Целевое применение 4

Целевое применение продукта 4

Назначение справочника по алгоритму 4

Принципы метода 5

Ограничения 6

Характеристики сети 7

Безопасность данных 8

Рабочий процесс использования алгоритма uPath HER2 Dual ISH 9

Рабочий процесс патоморфолога 11

Характеристики окрашивания 20

Функциональные характеристики 32

Сравнение методов 32

Исследования воспроизводимости результатов патоморфологов 33

Исследования воспроизводимости результатов сканеров 34

Поиск и устранение неисправностей 35

Библиографический список 39

Введение

Пакет Roche uPath enterprise software (uPath enterprise

software) с функцией анализа изображений uPath HER2

Dual ISH для алгоритма анализа тканей молочной железы

(алгоритма uPath HER2 Dual ISH) представляет собой

программное обеспечение, разработанное для содействия

при количественной оценке статуса гена HER2 методом

двухцветной хромогенной гибридизации in situ (ISH) в

фиксированных формалином в парафине (FFPE) образцах

нормальных и неопластических тканей.

Пакет uPath enterprise software— это комплексное цифровое

программное решение для изучения патологий, которое

позволяет патоморфологическим лабораториям получать,

обрабатывать, просматривать, анализировать, совместно

использовать и представлять отчеты по цифровым

изображениям образцов тканей с патологией. С помощью

пакета uPath enterprise software патоморфолог может

просматривать цифровые изображения в разных масштабах,

добавлять примечания, выполнять измерения срезов тканей,

проводить анализ изображений и составлять отчеты.

ПРИМЕЧАНИЕ. Алгоритм uPath HER2 Dual ISH представляет

собой вспомогательный компьютеризованный метод,

содействующий при получении и измерении изображений

предметных стекол образцов тканей, окрашенных с помощью

ISH, для определения статуса гена HER2. Чтобы обеспечить

обоснованность результатов анализа изображений,

патоморфолог должен подтвердить согласование за

счет применения соответствующих контролей, согласно

указаниям в маршрутной карте VENTANA HER2 Dual ISH DNA

Probe Cocktail (VENTANA HER2 Dual ISH) (размещено на сайте

dialog.roche.com).

1 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Краткий обзор и разъяснение алгоритма

Для областей применения анализа изображений

патоморфолог может использовать пакет uPath enterprise

software для выбора и выделения одной или двух (при

необходимости) областей исследования (ОИ) с помощью

инструмента Quick ROI (Быстрая ОИ). Каждую ОИ можно

просматривать в разных масштабах, а затем проводить их

анализ с помощью алгоритма uPath HER2 Dual ISH. Карта

интенсивности показывает патоморфологу области, в

которых, по данным определения с помощью алгоритма,

наблюдается активное усиление сигналов HER2.

Когда патоморфолог строит ОИ с помощью инструмента

Quick ROI (Быстрая ОИ) (инструмент Quick ROI [Быстрая

ОИ] обязательно следует использовать для выполнения

анализа) алгоритм uPath HER2 Dual ISH сначала выявляет

20характерных опухолевых клеток. Клетки ранжируются по

следующим параметрам: размер клетки, наличие хотя бы

одного сигнала HER2 и одного сигнала Chr17, а также степень

достоверности сегментации. Вычисляется общее количество

сигналов HER2 и Chr17 для 20характерных опухолевых

клеток. С помощью количественного определения сигналов

HER2 и Chr17 алгоритм uPath HER2 Dual ISH вычисляет

соотношение HER2/Chr17. Патоморфолог может одобрить

выбранные клетки и показатели, представленные

алгоритмом uPath HER2 Dual ISH, либо может вручную

заменить клетки и подставить другие показатели вместо

предложенных. Патоморфолог также может удалить

исходную ОИ, заменив ее на новую, построенную на более

подходящей области ткани.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH не производит

самостоятельную интерпретацию данных и поэтому

подлежит использованию квалифицированным

патоморфологом в сочетании с гистологическим

исследованием, надлежащими клиническими данными и

соответствующими контролями. Он разработан и показан к

применению патоморфологом в качестве вспомогательного

средства при оценке статуса гена HER2.

2 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Клиническая значимость

Рак молочной железы— наиболее распространенный

вид карциномы, развивающийся у женщин, и вторая из

основных причин смерти от онкологических заболеваний.

Общий прогноз можно существенно улучшить за счет

раннего выявления и применения соответствующих методов

лечения.

Несмотря на тот факт, что экспрессия белков

может быть различной в зависимости от подтипа карциномы

молочной железы, онкобелок c-erbB-2 (HER2) является

значимым маркером при раке молочной железы. HER2

представляет собой трансмембранный белок, встроенный

в клеточную мембрану. Его экспрессия при карциноме

молочной железы происходит на различных уровнях и с

различными профилями экспрессии.

Будучи тесно связанным с рецептором эпидермального

фактора роста, он обладает тирозинкиназной активностью,

что дает основание предполагать его возможное участие в

передаче сигнала и стимуляции митогенной активности.

Ген HER2, у людей расположенный на Chr17, кодирует белок

HER2. Сверхэкспрессия белка HER2, амплификация гена

HER2 или оба этих явления наблюдаются приблизительно

в 15–25% случаев рака молочной железы и обусловлены

агрессивным характером развития опухоли.

3–7

Гибридизацию in situ можно использовать для выявления

амплификации гена HER2 при инвазивной карциноме

молочной железы, что делает ее эффективным инструментом

патоморфологов при постановке диагноза и определения

прогноза для карцином. Тест VENTANA HER2 Dual ISH

предназначен для применения в лаборатории с целью

количественного выявления и определения гена HER2 в

срезах фиксированных формалином в парафине нормальных

и неопластических тканях. Преимуществом гистологических

препаратов тканей является тот факт, что интактные ткани

позволяют использовать возможности морфологии при

интерпретации положительного результата анализа образца

пациента на HER2. Интерпретацию всех гистологических

исследований должен выполнять специалист в области

морфологии и/или патоморфологии рака молочной железы.

Результаты должны быть подкреплены морфологическими

исследованиями и соответствующими контролями; при этом

их следует использовать вместе с другими клиническими и

лабораторными данными.

3 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Целевое применение продукта

Функция анализа изображений uPath HER2 Dual ISH для

алгоритма анализа тканей молочной железы предназначена

для применения патоморфологами в качестве

вспомогательного средства при определении статуса

гена HER2 путем определения соотношения гена HER2 к

хромосоме17 в фиксированных формалином в парафине

образцах неопластических тканей молочной железы. При

использовании с тестом VENTANA HER2 Dual ISH Assay она

предназначена для применения в качестве вспомогательного

средства при оценке состояния пациентов с раком молочной

железы, для которых рассматривается вариант лечения

препаратом Herceptin

(трастузумаб).

Примечание. Функция анализа изображений uPath HER2

Dual ISH для алгоритма анализа тканей молочной железы

представляет собой вспомогательный компьютеризованный

метод, содействующий при получении и измерении

изображений предметных стекол с образцами тканей,

подвергнутых обработке методом цветной хромогенной

гибридизации in situ (ISH), для определения статуса гена

HER2. Чтобы обеспечить обоснованность результатов

анализа изображений, патоморфолог должен подтвердить

согласование за счет применения соответствующих

контролей, согласно указаниям в маршрутной карте теста

VENTANA HER2 Dual ISH Assay (PN 1018383EN).

Данный алгоритм предназначен для применения при

диагностике in vitro (IVD).

Целевое применение

Назначение справочника по алгоритму

Данный справочник по алгоритму uPath HER2 Dual ISH

(справочник по алгоритму) предназначен для выполнения

следующих задач:

• Предоставление основных сведений о целевом

применении алгоритма uPath HER2 Dual ISH, а также о

принципах и ограничениях метода.

• Обозначение необходимых материалов, требований к ИТ,

безопасности данных и сети.

• Представление пошаговых инструкций по выполнению

алгоритма uPath HER2 Dual ISH.

• Представление фотографий, иллюстрирующих порядок

применения алгоритма uPath HER2 Dual ISH.

• Предоставление патоморфологам инструмента,

помогающего в применении алгоритма uPath HER2 Dual

ISH на FFPE срезах тканей молочной железы, окрашенных

с помощью теста VENTANA HER2 Dual ISH.

• Представление изображений с примерами сложных

случаев, чтобы показать, как использовать алгоритм

uPath HER2 Dual ISH для их оценки.

• Представление функциональных характеристик

алгоритма uPath HER2 Dual ISH.

4 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Принципы метода

Алгоритм количественной оценки для теста VENTANA

HER2 Dual ISH:

В тесте VENTANA HER2 Dual ISH DNA для определения

соотношения HER2/Chr17 используется алгоритм

количественной оценки. Алгоритм uPath HER2 Dual ISH был

разработан с соблюдением алгоритма количественной

оценки VENTANA HER2 Dual ISH (представлен далее) и

рабочего процесса, подробно описанного в маршрутной

карте теста VENTANA HER2 Dual ISH.

Пакет uPath enterprise software с алгоритмом uPath HER2

Dual ISH использует методики анализа изображений для

определения статуса гена HER2.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH использует предварительно

заданные параметры для оценки изображений тканей,

окрашенных с помощью теста VENTANA HER2 Dual ISH.

Этапы проведения анализа изображений:

• Выявление клеток по всему изображению.

• Определение клеток, пригодных для подсчета, и выбор

20характерных опухолевых клеток по следующим

параметрам: размер клетки, число красных и черных

сигналов, а также степень достоверности сегментации.

• Вычисление статуса гена HER2 путем деления общего

числа сигналов HER2 на общее число сигналов Chr17 в

соответствии с маршрутной картой теста VENTANA HER2

Dual ISH.

Как алгоритм uPath HER2 Dual ISH выявляет опухолевые

клетки, и как вычисляются показатели?

• Алгоритм uPath HER2 Dual ISH выявляет опухолевые

клетки, используя цвет, интенсивность, размер и

морфологические характеристики.

• Выявленные опухолевые клетки разделяют с помощью

предварительно заданных пороговых значений,

соответствующих маршрутной карте теста VENTANA

HER2 Dual ISH.

• Для вычисления статуса гена HER2 алгоритм uPath

HER2 Dual ISH определяет число выявленных сигналов

HER2 (черный цвет) и Chr17 (красный цвет) и формирует

соотношение HER2/Chr17 в соответствии с маршрутной

картой теста VENTANA HER2 Dual ISH.

Расчет соотношения HER2/Chr17 путем

деления

общего числа сигналов HER2

из целевой области1 на общее число

сигналов Chr17 из целевой области1

Подсчет сигналов HER2 и Chr17

в 20ядрах

Определить и выбрать целевую

область

Подсчет

дополнительных

20ядер

Регистрация

результатов

Без усиления

HER2/Chr17<2,0

С усилением

HER2/Chr17≥2,0

Расчет соотношения HER2/Chr17

путем деления общего числа

сигналов HER2 из целевых

областей1 и 2 на общее

число сигналов Chr17

из целевых областей1 и 2

Не соответствует

Пуск

HER2/Chr17

окрашенный

микропрепарат

Микропрепарат

соответствует

требованиям?

Находится ли

HER2/Chr17

в диапазоне 1,8–2,2?

Да

Нет

5 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH разработан для работы с

тестом VENTANA HER2 Dual ISH. Результаты исследования

фактически соответствуют качеству и точности предметного

стекла ISH, изображение которого получают, и полученного в

результате изображения, которое анализируют.

Патоморфолог должен валидировать окрашивание в

рамках теста VENTANA HER2 Dual ISH путем изучения

предметного стекла в пакете uPath enterprise software,

используя внутренние контроли, чтобы подтвердить

получение ожидаемых результатов до выполнения анализа

изображений предметных стекол.

Используйте рекомендации производителя к тесту VENTANA

HER2 Dual ISH, в том числе применяя все материалы для

положительного и отрицательного контроля качества в ходе

каждого цикла окрашивания. Если внутренние контроли

не отвечают требованиям, повторите окрашивание ткани с

приемлемыми результатами.

Патоморфолог должен следовать рекомендациям по

интерпретации результатов теста VENTANA HER2 Dual ISH.

См.маршрутную карту (P/N1018383EN) и руководство по

интерпретации (P/N1018386EN) теста VENTANA HER2 Dual

ISH (размещено на сайте dialog.roche.com).

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH разработан для применения

квалифицированным патоморфологом в сочетании

с гистологическим исследованием, надлежащими

клиническими данными и соответствующими контролями.

Он не подходит для применения в качестве самостоятельного

инструмента и требует участия компетентного специалиста в

процессе анализа.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH может генерировать

неправильные показатели при наличии отклонений в

окрашивании на полученных изображениях (окрашивание

нецелевой области, избыточное контр-окрашивание и т.п.).

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH может отбраковать

продолговатые ядра опухолевых клеток, несмотря на

общую форму клетки. По этой причине опухоли с большим

числом клеток с продолговатыми ядрами могут потребовать

проведения оценки вручную.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH отрабатывали, разрабатывали

и валидировали на образцах тканей инвазивной карциномы.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH не проверяли на работу

на персональном компьютере (PC) из дома; также при

этих условиях не валидировали его безопасность и

эффективность.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH может неправильно

определить лимфоциты как опухолевые клетки.

Патоморфологу следует визуально тщательно проверить

ткани и, по возможности, избегать тех областей, где

иммуноциты составляют более 30% всех клеток.

Алгоритм uPath HER2 Dual ISH предназначен для применения

в качестве вспомогательного средства при выявлении

пациентов, нуждающихся в лечении препаратом Herceptin,

по данным амплификации гена HER2 в соответствии с

утвержденной инструкцией по применению лекарственного

препарата.

Ограничения

6 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Характеристики сети

Между пакетом uPath enterprise software и системой управления изображениями (IMS) рекомендуется использовать сетевое

подключение со скоростью 1Гбит/с.

Таблица1. Спецификации сервера анализа изображений Roche uPath для небольших лабораторий.

Параметр Характеристики

Процессор ЦП с частотой 3,6ГГц

Количество ядер 4

ОЗУ 6×8Гб (48Гб)

Гиперпотоковая обработка Отключена

Винчестер 240Гб, SSD

Операционная система Microsoft Windows Server 2016

Поддержка виртуальных машин (VM) Да

Дополнительная информация о VM Производительность до физических серверов будет другой из-за непроизводительных

потерь VM.

Антивирус Symantec Endpoint Protection версии12

Электропитание 110/220В, 800Вт (2)

Порты 2USB, адаптер HPE Ethernet на 10/25Гб

Источник бесперебойного питания Рекомендуется

Таблица2. Спецификации сервера анализа изображений Roche uPath для средних и крупных лабораторий.

Параметр Характеристики

Процессор ЦП с частотой 3,6ГГц (2процессора)

Количество ядер 8 на процессор/16 всего

ОЗУ 12×8Гб (96Гб)

Гиперпотоковая обработка Отключена

Винчестер 240Гб, SSD (2шт.)

Операционная система Microsoft Windows Server 2016

Поддержка виртуальных машин (VM) Да

потерь VM.

Антивирус Symantec Endpoint Protection версии12

Электропитание 110/220В, 800Вт (2)

Порты 2USB, адаптер HPE Ethernet на 10/25Гб

Источник бесперебойного питания Рекомендуется

7 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Вредоносное программное обеспечение или

несанкционированный доступ к прибору могут стать

причиной потери данных или невозможности использования

прибора.

Чтобы предотвратить заражение прибора вредоносным

программным обеспечением или несанкционированный

доступ и ненадлежащее использование прибора, важно

следовать приведенным далее рекомендациям:

• Запрещается устанавливать или запускать на приборе

другое программное обеспечение.

• Следует обеспечить надлежащую безопасность

и защиту других компьютеров и оборудования в

сети от вредоносного программного обеспечения и

несанкционированного доступа. Например, это относится

к лабораторной информационной системе (ЛИС), общему

архивному хранилищу, общему резервному хранилищу

или службам.

• Заказчики несут ответственность за безопасность

собственной локальной вычислительной сети, в

частности, за ее защиту от вредоносного программного

обеспечения и атак. Эта защита может включать такие

меры, как, например, межсетевой экран, для отделения

устройства от неконтролируемых сетей. К такой

защите также могут относится меры, направленные

на обеспечение отсутствия вредоносного кода в

подключенной сети.

• Следует ограничить непосредственный доступ к

прибору и ко всем подключенным к нему элементам

инфраструктуры ИТ (компьютерам, кабелям, сетевому

оборудованию и т.п.).

• Следует обеспечить защиту файлов резервных копий

и архивов прибора от несанкционированного доступа

и чрезвычайных происшествий. В этот список следует

включить место удаленного хранилища, узлы аварийного

восстановления и безопасный перенос файлов

резервных копий.

• По возможности, для ограничения сетевого трафика

следует использовать межсетевой экран.

• Для некоторых видов резервного копирования и

восстановления можно использовать флеш-накопители

USB. Ненадлежащее обращение с флеш-накопителем

USB может привести к потере данных или неисправности

прибора.

Безопасность данных

• Используйте только те флеш-накопители USB, которые

были проверены и установлены сотрудником местной

службы поддержки компании Roche.

• В любой отдельно взятый момент времени можно

использовать только одно USB-устройство. Прежде чем

подключить к прибору флеш-накопитель USB, убедитесь в

отсутствии другого установленного в него USB-устройства.

• Прежде чем извлечь флеш-накопитель USB, нажмите

кнопку «Извлечь» в Windows.

• Конфигурацию операционной системы (ОС) по

умолчанию, предлагаемую вместе с сервером, нельзя

изменять, поскольку это отразится на параметрах

отказоустойчивости конфигурации ОС.

• Чтобы предотвратить заражение пакета uPath enterprise

software вирусом, используйте флеш-накопитель USB

только с данным прибором. Не храните на этом флеш-

накопителе USB другие данные.

8 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Рабочий процесс использования алгоритма uPath HER2 Dual ISH

Предоставляемые материалы

• Алгоритм uPath HER2 Dual ISH

Материалы, которые необходимы, но не входят в комплект поставки

• Пакет uPath enterprise software

• Предметные стекла с образцами ткани молочной железы, окрашенные с помощью теста VENTANA HER2 Dual ISH (с

использованием наборов для детектирования VENTANA Silver ISH DNP и VENTANA Red ISH DIG) на приборе BenchMark ULTRA

• Сканер микропрепаратов VENTANA DP200

Особые указания и меры предосторожности

1. Только для диагностики in vitro (IVD).

2. Только для профессионального применения.

3. ВНИМАНИЕ! Федеральное законодательство США разрешает продажу этого устройства только врачу или по заказу

врача. (Rx only)

4. Чтобы сообщить о подозрении на серьезное происшествие в связи с данным устройством, обратитесь к местному

представителю компании Roche, а также в компетентные органы государства-участника ЕС или страны, в которой

зарегистрирован пользователь.

Рабочий процесс

1. Образец ткани молочной железы на предметном стекле окрашивают с помощью теста VENTANA HER2 Dual ISH на

приборе BenchMark ULTRA.

2. Изображение (сканирование микропрепарата целиком) получают с помощью сканера микропрепаратов VENTANA DP200

при 40-кратном увеличении в одной плоскостиZ.

3. После получения цифровых изображений их переносят с компьютера, связанного со сканером микропрепаратов

VENTANA DP200, в систему управления изображениями (IMS) на централизованном сервере.

4. После переноса на сервер в пакете uPath enterprise software создается карта данных. Создание карты данных

происходит автоматически при обмене данными с лабораторной информационной системой (ЛИС) с использованием

идентификационной информации (например, тип ткани и тест), которая указана на этикетке со штрих-кодом

предметного стекла или была введена вручную в пакет uPath enterprise software (см.руководство пользователя uPath

enterprise software [PN 1018943EN]).

5. Если алгоритм uPath HER2 Dual ISH установлен (а он должен быть установлен на отдельном от пакета uPath enterprise

software и IMS сервере), а изображение с 40-кратным увеличением зарегистрировано с соответствующим окрашиванием

и типом ткани, пакет uPath enterprise software автоматически запустит анализ микропрепарата целиком (WSA).

6. WSA автоматически анализирует все отсканированное изображение.

7. По завершении WSA программное обеспечение выведет для патоморфолога уведомление, что «analysis is complete»

(анализ выполнен).

8. После оценки изображения патоморфолог сможет переключить карту интенсивности, на которой будут выделены

области, подходящие для оценки показателей по наличию сигналов HER2.

9. После определения подходящей области патоморфолог может выбрать ОИ с помощью инструмента Quick ROI (Быстрая

ОИ), который автоматически формирует квадрат размером 0,4мм×0,4мм для оценки 20характерных опухолевых клеток,

выбранных алгоритмом uPath HER2 Dual ISH по следующим параметрам: размер клетки, число сигналов HER2 и Chr17, а

9 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

также степень достоверности сегментации. Если патоморфолог не согласен с выбором клеток, он может удалять и добавлять

клетки, выбирая их на панели ROI Details (Характеристики ОИ) или внутри ОИ. Патоморфолог также может удалить исходную

ОИ, заменив ее на новую, построенную на более подходящей области ткани.

10. Если соотношение HER2/Chr17 находится в диапазоне от 1,8 до 2,2, патоморфолог сможет использовать инструмент

Quick ROI (Быстрая ОИ) для построения второй ОИ и анализа второго набора из 20клеток в соответствии с маршрутной

картой теста VENTANA HER2 Dual ISH. Однако если показатель для первой ОИ < 1,8 или > 2,2, инструмент Quick ROI

(Быстрая ОИ) будет отключен, а статус гена HER2 будет основан только на данных первой ОИ. Если патоморфолог не

согласен с полученным показателем, он может вручную скорректировать данные алгоритма.

Окрашивание

• Подготовку и окрашивание тканей следует выполнять в соответствии с рекомендациями, представленными в

маршрутной карте теста VENTANA HER2 Dual ISH.

• Все соответствующие контроли необходимо проверить, и повторить окрашивание предметных стекол, если изначальное

окрашивание не соответствует рекомендациям, изложенным в маршрутной карте теста VENTANA HER2 Dual ISH.

• Перед проведением анализа для окрашивания тканей алгоритм uPath HER2 Dual ISH требует применения теста VENTANA

HER2 Dual ISH, а также всех дополнительных материалов или принадлежностей, перечисленных в маршрутной карте

теста VENTANA HER2 Dual ISH.

• Тест VENTANA HER2 Dual ISH определяет статус гена HER2 в FFPE образцах тканей молочной железы, окрашенных с

помощью наборов для детектирования VENTANA Silver ISH DNP и VENTANA Red ISH DIG на приборе BenchMark ULTRA.

Получение изображения

Для сканирования предметных стекол необходим сканер микропрепаратов VENTANA DP200. Изображения необходимо

сканировать при 40-кратном увеличении. Образцы тканей должны быть без складок и красителя. Если большие участки

изображения находятся не в фокусе, рекомендуется повторить сканирование предметных стекол. Дополнительную

информацию о сканировании см.в руководстве пользователя сканера микропрепаратов VENTANA DP200 (PN1017149RU).

Общее управление в системе: пакет uPath enterprise software

Пакет uPath enterprise software рассчитан на настройку и адаптацию под требования отдельного пользователя и учреждения,

включая (без ограничения) конфигурацию отчетности и интерфейса пользователя. Данный справочник по алгоритму

нацелен на изучение инструментов, необходимых для применения только алгоритма uPath HER2 Dual ISH. Дополнительную

информацию о пакете uPath enterprise software см.в руководстве пользователя uPath enterprise software.

10 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Рабочий процесс патоморфолога

Открытие карты данных

Доступ к изображениям ткани молочной железы, окрашенной с помощью теста VENTANA HER2 Dual ISH DNA, возможен при

двойном щелчке по карте данных, либо при выборе карты данных и нажатии на вкладку viewer (средство просмотра) в пакете

uPath enterprise software (рисунок1).

Появится экран со всеми изображениями, связанными с картой данных (рисунок2).

Рисунок2

Рисунок1

11 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

После сканирования предметного стекла, окрашенного с помощью теста VENTANA HER2 Dual ISH, на сканере

микропрепаратов VENTANA DP200 при 40-кратном увеличении, изображение импортируется в пакет uPath enterprise software

и соотносится с картой данных. Алгоритм uPath HER2 Dual ISH автоматически запускает WSA. Время на выполнение этапа

предварительного расчета в рамках WSA зависит от спецификаций сервера, размера изображений и количества изображений

в очереди. Когда отображается сообщение «waiting to start auto-analysis» (ожидается запуск автоматического анализа), это

означает, что изображения находятся в очереди и еще не проанализированы, а сообщение «analyzing» (выполняется анализ)

используется во время выполнения WSA (рисунки3 и4). После полного анализа изображения с помощью WSA в пакете uPath

enterprise software сообщение «analysis successful» (анализ выполнен успешно) будет выведено на экран под изображением

предметного стекла внутри средства просмотра в пакете uPath enterprise software (рисунок5). Оценка показателей

изображения невозможна до успешного выполнения WSA.

Карта интенсивности

Этап предварительного расчета в рамках WSA предусматривает формирование алгоритмом uPath HER2 Dual ISH карты

интенсивности, доступной на панели Slide Navigator (Навигатор микропрепаратов) (рисунок6). Карту интенсивности можно

включить или выключить с помощью кнопок Hide Heatmap (Скрыть карту интенсивности) и Show Heatmap (Показать карту

интенсивности) в правом нижнем углу панели Slide Navigator (Навигатор микропрепаратов) (рисунок6). Карта интенсивности

предназначена для выявления областей с усиленными сигналами HER2, которые считаются оптимальными для оценки

показателей на основании и в соответствии с руководством по интерпретации теста VENTANA HER2 Dual ISH. Она меняется в

диапазоне от желтого (нижний предел соотношения HER2/Chr17) до красного цвета (верхний предел соотношения HER2/Chr17).

Никакого наложения не будет в тех областях (и картах данных), где алгоритм не обнаружил усиления. Несмотря на данные,

показанные в карте интенсивности, патоморфологу следует проверить изображений так же, как при считывании вручную.

Рисунок5

Рисунок3

Рисунок4

Рисунок6

ПРИМЕЧАНИЕ. В данном примере у большой части образца ткани высокий показатель соотношения HER2/Chr17,

что показано в виде областей темно-красного цвета на карте интенсивности.

12 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Наложение клеток, пригодных для подсчета

Наложение, выделяющее клетки, пригодные для подсчета, красным цветом, появляется при увеличении масштаба

изображения в 20 или более раз (рисунок7). Алгоритм uPath HER2 Dual ISH выбирает клетки, пригодные для подсчета,

по следующим критериям: размер, наличие хотя бы одного сигнала HER2 и одного сигнала Chr17, а также степень

достоверности сегментации (клетка четко отделяется от соседних клеток). Если любой из трех критериев не выполнен,

клетка будет считаться непригодной для подсчета, и наложение не появится. Наложение выявляет клетки, пригодные для

подсчета, позволяя пользователю определять области с достаточным количеством таких опухолевых клеток.

После проверки изображения и определения области исследования (область опухолевых клеток и соответствующих клеток

для внутреннего контроля окрашивания) используйте инструмент Quick ROI (Быстрая ОИ) для запуска анализа (рисунок8).

Рисунок7

Рисунок8

13 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

После выбора инструмента Quick ROI (Быстрая ОИ) произойдет следующее:

1. Появится ОИ размером 0,4мм×0,4мм, расположенная по центру средства просмотра (рисунок9).

2. Наложение всех клеток, пригодных для подсчета, пропадет с ОИ.

3. Появится наложение красного цвета, выделяющее 20характерных опухолевых клеток, которые были выбраны

алгоритмом uPath HER2 Dual ISH в пределах данной ОИ (рисунок9).

4. Количество HER2 и Chr17 для каждой клетки в пределах ОИ появится внутри выпадающей панели ROI Details

(Характеристики ОИ) (рисунок10).

5. Соотношение HER2/Chr17, общее число сигналов HER2 и общее число сигналов Chr17 будут вычислены и выведены на

экран внутри выпадающей панели ROI Details (Характеристики ОИ) (рисунок10). Панель ROI Details (Характеристики ОИ)

можно включить нажатием на значок раскрытия (рисунок11).

Рисунок11Рисунок9 Рисунок10

14 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Патоморфологи могут выбрать одну из 20характерных опухолевых клеток с красным наложением, чтобы вывести на экран

соответствующее число сигналов HER2 и Chr17 в пределах этой клетки в соответствии с определением, выполненными

алгоритмом uPath HER2 Dual ISH.

Теперь клетка будет обведена зеленым цветом, а соответствующее количество сигналов будет выделено синим цветом на

выпадающей панели ROI Details (Характеристики ОИ) (рисунок12). И наоборот, выбор одной из 20клеток в списке Cell

Count (Число клеток) на выпадающей панели ROI Details (Характеристики ОИ) приведет к выделению соответствующей

клетки зеленым цветом.

Рисунок12

15 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Quick ROI (Быстрая ОИ): Удаление

Если выбранная ОИ не является оптимальной, ее можно удалить. Выберите инструмент Quick ROI (Быстрая ОИ), щелкнув

по любой точке ОИ, а затем выберите значок Delete (Удалить) внутри Slide Panel (Панель микропрепарата) (рисунок13)

или внутри изображения предметного стекла рядом с ОИ (рисунок14). На экране появится окно подтверждения. Выберите

Conﬁrm (Подтвердить), чтобы удалить выбранную ОИ. Выберите Cancel (Отмена), чтобы оставить ОИ.

Quick ROI (Быстрая ОИ): Замена клеток

Если выбранная клетка (или клетки), определенные алгоритмом uPath HER2 Dual ISH, не соответствуют рекомендациям,

изложенным в маршрутной карте теста VENTANA HER2 Dual ISH, выберите клетку, щелкнув по центру клетки или выбрав

клетку из списка Cell Count (Число клеток). Удалите клетку, выбрав значок Delete (Удалить) внутри выпадающей панели

ROI Details (Характеристики ОИ) над кнопкой Conﬁrm (Подтвердить) (рисунок15). После выбора значка Delete (Удалить)

количество клеток HER2 и Chr17 будет удалено из списка клеток, а соответствующая выделенная клетка будет удалена с ОИ

(ряд8 на рисунке16). После этого станет активным значок Add (Добавить) (рисунок16). Выберите кнопку Add (Добавить) и

обведите новую клетку, которую необходимо оценить.

Рисунок14

Рисунок13

Рисунок15

Рисунок16

16 Анализ изображений uPath HER2 Dual ISH для справочника по алгоритму анализа тканей молочной железы

Страница загружается...

Roche uPath IVD Руководство пользователя

Похожие модели бренда

Модели других брендов